根據此前飛行路線，CX899將在經過俄羅斯和蒙古領空后由北向南穿越中國內地抵達香港。但是，當日該航班沒有卻從俄羅斯上空直接飛到日本關西國際機場備降。

CX899正常飛行路線

11日CX899飛行路線

由于12日大量示威者在香港機場集會，12日和13日的CX899次航班均取消。

12日，國泰航空行政總裁何杲當天向員工發出內部信稱，員工不應參與機場集會，如果有人支持或參與非法抗議活動將接受紀律處分，最嚴重可被勒令離職。大批示威者12日下午進入機場后，國泰再度向員工發出郵件，通知員工因為所有離境航班已取消，要求所有機組人員留在家中。

13日，記者收到國泰航空方面發來的聲明。國泰航空表示，鑒于8月12日的香港國際機場非法集會,加上航空交通流量管制，有很多長途航班正在飛行途中，需要排隊方可降落。為了緩解航空交通堵塞情況，國泰航空特安排CX899由紐約飛往香港不載客的航班備降日本大阪關西機場，減少旅客的不便。此舉與民航局近日對國泰提出的警示無關。